В [b]head[/b] или после [b]</head>[/b]

<?if(!$USER_LOGGED_IN$)?>      
<script type="text/javascript">      
$(document).ready(function(){      
_uWnd.alert('Вы не зарегистрированы.<br><a href="$REGISTER_LINK$" target="_blank">Регистрация</a>','Guest, hello',{w: 200, h: 100, tm: 15000});});      
</script>      
<?endif?>